Рассмотрены методы автоматизированного количественного анализа структуры композиционных материалов, обладающих биологической активностью — биологических объектов естественного происхождения, и материалов, созданных методом иммобилизации биологических объектов на пористых носителях. В последнем случае описан автоматизированный количественный анализ показателей структуры носителей для биологически активных композиционных материалов, в которые интегрируются биологически активные компоненты. Показано, что для каждого уровня пространственной организации биоактивных композитов важен учет количественных характеристик структурных элементов носителя, как на технологическом этапе их формирования, так и в процессе их функционирования. Выделен особо сложный класс биокомпозиционных материалов — комплексов полимер — живая ткань. Прослежены основные тенденции развития техники визуализации и количественного анализа структуры биоактивных композиционных материалов. Обсуждаются примеры использования количественных характеристик структурных показателей в прогнозировании функциональных свойств биологических объектов (биополимеров, клеток, тканей, органов, организмов). Рассмотрена перспектива развития молекулярной и клеточной микромеханики.